معاونت بهداشتي زير مجموعه دانشگاه علوم پزشكي و خدمات بهداشتي درماني مي باشد و بر اساس شرح وظائف پيش بيني شده در سيستم بهداشتي

( با مديريت معاونت بهداشتي) در تعداد 9 واحد ستادي به امر برنامه ريزي، هدايت، نظارت، سازماندهي برنامه ها و ارزشيابي آنها در سطح مراكز بهداشت شهرستانها (باهماهنگي و همكاري ساير معاونت هاي دانشگاه) مي پردازد.

اين معاونت علاوه بر ارتباط با رياست دانشگاه و ساير معاونت هاي مربوطه به طور مستقيم با معاونت سلامت و همچنين ادارات كل (مربوط به هر واحد ستادي)

در سطح وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشكي در ارتباط مي باشد و از سوي آنها پشتيباني (علمي_‌ مالي و ...) ،هدايت ، نظارت و سازماندهي مي گردد.